通常无菌室使用紫外灯时，为达到佳的消毒效果，要求紫外灯照射时间超过30分钟以上，并且为保证操作者的人身健康，建议关闭紫外灯30分钟后方可进入无菌室进行无菌操作。
依据消毒杀菌技术标准的指导，每一种微生物都有其特定紫外线杀灭、死亡剂量标准，其剂量是照射强度与照射时间的乘积【K(杀菌剂量)＝I(照射强度)t(照射时间)】。从公式得知，高强度短时间与低强度长时间之照射其效果是相同的。所以新紫外线灯开30分钟可达到杀菌要求，但紫外线灯老化或有灰尘应适当延长杀菌时间。
紫外线对细菌有强大的杀伤力，对人体同样有一定的伤害，人体易受伤的部位是眼睛之眼角膜，因此在任何时候都不可用眼睛直视点亮着的灯管，以免受伤，万一必须要看时，应用普通玻璃(戴眼镜)或透光塑料片，作为防护面罩。千万勿错用石英玻璃，因为普通玻璃对紫外线几乎完全无法透过的。一旦受伤，不必惊慌，面部灼伤，几天后表皮脱落，不药而愈。眼睛受伤会红肿、流泪、刺痛，约三、四天才能。不论如何，一遇到伤害，仍然建议立即至医生处求诊。
